Notei que o CNPJ que o Trademap colocou era do administrador e não do fundo imobiliário especificamente, é isso mesmo?

Na tela de Bens e Direitos, o CNPJ a ser informado deve ser sempre do próprio fundo. Ou seja , se você tinha na carteira, por exemplo, o ativo XPLG11 , você deverá informar o CNPJ desse fundo, que seria o 26.502.794/0001-85. 

Já na tela de Rendimentos Isentos e não triubutáveis onde você vai declarar quais foram os rendimentos recebidos daquele fundo durante o ano, você deverá informar o CNPJ do Adiministrador , que nesse caso por exemplo é o 22.610.500/0001-88 - VÓRTX DISTRIBUIDORA DE TÍTULOS E VALORES MOBILIÁRIOS LTDA.

Lembrando que o Trademap já faz a tratativa considerando esses critérios :)